<div dir="ltr"><div><div>I am trying to compute ensemble spread from a 10 member ensemble (convective scale configuration). The field for which I am trying to compute standard deviation includes thermodynamic indices like CAPE and CIN. Since I am doing this for cases featuring rather high amounts of CAPE, I suspect this is the reason my script is overloading on memory and crashing. I know this because I have the script setup to easily compute ensemble standard deviation for just about any field, and I have had no troubles computing spread for temperature, moisture, and wind. Yet, just changing the name of the field causes the script to crash.<br><br></div>Is there anything that can be done to get around this? I have attached the script code to this email.<br><br></div><div>Here is some output from the jobs running the script:<br>/home/jdduda/grads_scripts<br>Tue Oct 27 15:06:13 CDT 2015<br><br>Grid Analysis and Display System (GrADS) Version 2.1.a3<br>Copyright (C) 1988-2015 by the Institute for Global Environment and Society (IGES)<br>GrADS comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY<br>See file COPYRIGHT for more information<br><br>Config: v2.1.a3 little-endian readline grib2 netcdf hdf4-sds hdf5 opendap-grids,stn geotiff shapefile cairo<br>Issue &#39;q config&#39; command for more detailed configuration information<br>GX Package Initialization: Size = 11 8.5 <br>Running in Batch mode<br>All files closed; all defined objects released;<br>All GrADS attributes have been reinitialized<br>Notice: Implied interpolation for file /work/jdduda/analysis/FLSM/WRFPRS_FLSM.ctl<br> Interpolation will be performed on any data displayed from this file<br>Notice: Implied interpolation for file /work/jdduda/analysis/MLSM/WRFPRS_MLSM.ctl<br> Interpolation will be performed on any data displayed from this file<br>Notice: Implied interpolation for file /work/jdduda/analysis/LSMO/WRFPRS_LSMO.ctl<br> Interpolation will be performed on any data displayed from this file<br>Data Request Warning:  Request is completely outside file limits<br>Data Request Warning:  Request is completely outside file limits<br>Define Error:  Unable to allocate data memory<br>  Size of request was -18950400 grid elements<br>Abort (core dumped)<br>Tue Oct 27 15:22:30 CDT 2015<br><br>*** glibc detected *** /home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads: double free or corruption (!prev): 0x0000000005f12580 ***<br>======= Backtrace: =========<br>/lib64/libc.so.6[0x3000475e66]<br>/lib64/libc.so.6[0x30004789b3]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gree+0x2bb)[0x4fb4b2]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gadef+0x1597)[0x51921a]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gacmd+0x2074)[0x52e93c]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gagsdo+0x33)[0x5301d3]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsstmt+0x6e)[0x4f5fc5]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsruns+0x4f)[0x4f610e]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsrund+0xdd)[0x4f6679]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsruns+0x8c)[0x4f614b]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsruni+0x95)[0x4f6557]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsruns+0x11b)[0x4f61da]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsrund+0xdd)[0x4f6679]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsruns+0x8c)[0x4f614b]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsrund+0xdd)[0x4f6679]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsruns+0x8c)[0x4f614b]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsrunf+0x2e9)[0x4f69e2]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gsfile+0x290)[0x4f6d7d]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(gacmd+0x1162)[0x52da2a]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads(main+0x962)[0x4a5e59]<br>/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xfd)[0x300041ed5d]<br>/home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads[0x4a4a09]<br>======= Memory map: ========<br>00400000-00dea000 r-xp 00000000 00:31 196231175                          /home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads<br>00fe9000-0106c000 rw-p 009e9000 00:31 196231175                          /home/jdduda/grads-2.1.a3/bin/grads<br>0106c000-04368000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>05eb9000-0b20e000 rw-p 00000000 00:00 0                                  [heap]<br>3000000000-3000020000 r-xp 00000000 fd:00 182476                         /lib64/<a href="http://ld-2.12.so">ld-2.12.so</a><br>300021f000-3000220000 r--p 0001f000 fd:00 182476                         /lib64/<a href="http://ld-2.12.so">ld-2.12.so</a><br>3000220000-3000221000 rw-p 00020000 fd:00 182476                         /lib64/<a href="http://ld-2.12.so">ld-2.12.so</a><br>3000221000-3000222000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>3000400000-300058a000 r-xp 00000000 fd:00 182477                         /lib64/<a href="http://libc-2.12.so">libc-2.12.so</a><br>300058a000-300078a000 ---p 0018a000 fd:00 182477                         /lib64/<a href="http://libc-2.12.so">libc-2.12.so</a><br>300078a000-300078e000 r--p 0018a000 fd:00 182477                         /lib64/<a href="http://libc-2.12.so">libc-2.12.so</a><br>300078e000-300078f000 rw-p 0018e000 fd:00 182477                         /lib64/<a href="http://libc-2.12.so">libc-2.12.so</a><br>300078f000-3000794000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>3000800000-3000817000 r-xp 00000000 fd:00 182479                         /lib64/<a href="http://libpthread-2.12.so">libpthread-2.12.so</a><br>3000817000-3000a17000 ---p 00017000 fd:00 182479                         /lib64/<a href="http://libpthread-2.12.so">libpthread-2.12.so</a><br>3000a17000-3000a18000 r--p 00017000 fd:00 182479                         /lib64/<a href="http://libpthread-2.12.so">libpthread-2.12.so</a><br>3000a18000-3000a19000 rw-p 00018000 fd:00 182479                         /lib64/<a href="http://libpthread-2.12.so">libpthread-2.12.so</a><br>3000a19000-3000a1d000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>3000c00000-3000c83000 r-xp 00000000 fd:00 143874                         /lib64/<a href="http://libm-2.12.so">libm-2.12.so</a><br>3000c83000-3000e82000 ---p 00083000 fd:00 143874                         /lib64/<a href="http://libm-2.12.so">libm-2.12.so</a><br>3000e82000-3000e83000 r--p 00082000 fd:00 143874                         /lib64/<a href="http://libm-2.12.so">libm-2.12.so</a><br>3000e83000-3000e84000 rw-p 00083000 fd:00 143874                         /lib64/<a href="http://libm-2.12.so">libm-2.12.so</a><br>3001000000-3001002000 r-xp 00000000 fd:00 182478                         /lib64/<a href="http://libdl-2.12.so">libdl-2.12.so</a><br>3001002000-3001202000 ---p 00002000 fd:00 182478                         /lib64/<a href="http://libdl-2.12.so">libdl-2.12.so</a><br>3001202000-3001203000 r--p 00002000 fd:00 182478                         /lib64/<a href="http://libdl-2.12.so">libdl-2.12.so</a><br>3001203000-3001204000 rw-p 00003000 fd:00 182478                         /lib64/<a href="http://libdl-2.12.so">libdl-2.12.so</a><br>3001800000-3001807000 r-xp 00000000 fd:00 182480                         /lib64/<a href="http://librt-2.12.so">librt-2.12.so</a><br>3001807000-3001a06000 ---p 00007000 fd:00 182480                         /lib64/<a href="http://librt-2.12.so">librt-2.12.so</a><br>3001a06000-3001a07000 r--p 00006000 fd:00 182480                         /lib64/<a href="http://librt-2.12.so">librt-2.12.so</a><br>3001a07000-3001a08000 rw-p 00007000 fd:00 182480                         /lib64/<a href="http://librt-2.12.so">librt-2.12.so</a><br>3001c00000-3001c16000 r-xp 00000000 fd:00 144099                         /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1<br>3001c16000-3001e15000 ---p 00016000 fd:00 144099                         /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1<br>3001e15000-3001e16000 rw-p 00015000 fd:00 144099                         /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1<br>3002800000-30028e8000 r-xp 00000000 fd:00 182510                         /usr/lib64/libstdc++.so.6.0.13<br>30028e8000-3002ae8000 ---p 000e8000 fd:00 182510                         /usr/lib64/libstdc++.so.6.0.13<br>3002ae8000-3002aef000 r--p 000e8000 fd:00 182510                         /usr/lib64/libstdc++.so.6.0.13<br>3002aef000-3002af1000 rw-p 000ef000 fd:00 182510                         /usr/lib64/libstdc++.so.6.0.13<br>3002af1000-3002b06000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>3008c00000-3008d37000 r-xp 00000000 fd:00 144301                         /usr/lib64/libX11.so.6.3.0<br>3008d37000-3008f37000 ---p 00137000 fd:00 144301                         /usr/lib64/libX11.so.6.3.0<br>3008f37000-3008f3d000 rw-p 00137000 fd:00 144301                         /usr/lib64/libX11.so.6.3.0<br>3009000000-3009002000 r-xp 00000000 fd:00 143787                         /usr/lib64/libXau.so.6.0.0<br>3009002000-3009202000 ---p 00002000 fd:00 143787                         /usr/lib64/libXau.so.6.0.0<br>3009202000-3009203000 rw-p 00002000 fd:00 143787                         /usr/lib64/libXau.so.6.0.0<br>3009400000-300941d000 r-xp 00000000 fd:00 143793                         /usr/lib64/libxcb.so.1.1.0<br>300941d000-300961d000 ---p 0001d000 fd:00 143793                         /usr/lib64/libxcb.so.1.1.0<br>300961d000-300961e000 rw-p 0001d000 fd:00 143793                         /usr/lib64/libxcb.so.1.1.0<br>3018800000-3018811000 r-xp 00000000 fd:00 131862                         /usr/lib64/libXext.so.6.4.0<br>3018811000-3018a11000 ---p 00011000 fd:00 131862                         /usr/lib64/libXext.so.6.4.0<br>3018a11000-3018a12000 rw-p 00011000 fd:00 131862                         /usr/lib64/libXext.so.6.4.0<br>2b2ffc989000-2b2ffc98a000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>2b2ffc9a4000-2b2ffcf33000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>2b2ffcf3b000-2b300019d000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>2b3004000000-2b3004021000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>2b3004021000-2b3008000000 ---p 00000000 00:00 0 <br>2b3009231000-2b30122c6000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>2b301b353000-2b302d57d000 rw-p 00000000 00:00 0 <br>7fff6c227000-7fff6c23d000 rw-p 00000000 00:00 0                          [stack]<br>7fff6c2ec000-7fff6c2ed000 r-xp 00000000 00:00 0                          [vdso]<br>ffffffffff600000-ffffffffff601000 r-xp 00000000 00:00 0                  [vsyscall]<br><br></div>Jeff Duda<br clear="all"><div><div><div><br>-- <br><div class="gmail_signature">Jeff Duda<br>Graduate research assistant<br>University of Oklahoma School of Meteorology<br>Center for Analysis and Prediction of Storms<br></div>
</div></div></div></div>